登場人物

江戶川柯南／工藤新一

本是頗有知名度的高中生偵探，在某次出遊目擊交易現場而被黑衣組織灌下被稱為APTX4869的神秘藥物，變成了小學生的模樣。為了得到黑衣組織的消息，現居毛利偵探事務所，仍利用各種方式解決了許多案子。

灰原哀／宮野志保

原為黑衣組織的成員，代號雪莉，正是APTX4869的開發者。因為姊姊的死而背叛了組織，服下毒藥後和柯南一樣變成小孩逃出了組織，現在住在阿笠博士家，並和柯南一起到帝丹小學上課。

服部平次

關西的高中生名偵探，推理能力和同年的工藤不相上下；跟父親學來的劍道也相當擅長，另外他的黑皮膚是來自爺爺的隔代遺傳。也是少數知道柯南就是新一的其中一人，會跟柯南一起解決許多困難的案件。

毛利小五郎

人稱「沉睡的小五郎」的名偵探，經營毛利偵探事務所。喜歡喝酒與賽馬。

遠山和葉

服部平次的青梅竹馬，大阪警視廳搜查一課警官服部平藏的女兒，擅長合氣道。

小嶋元太

自稱少年偵探團的團長，喜歡踢足球和吃鰻魚飯。

吉田步美

少年偵探團的一員，個性積極活潑，擁有十足的冒險勇氣。

圓谷光彥

少年偵探團的一員，相當勤奮好學，有作筆記的習慣。